Si Kagari ng "Yanninshu" ay isang inapo ng mga ninja na nabuhay sa pagitan ng kapangyarihan at ng mga mamamayan mula pa bago ang panahon ng Edo. Sa pagtatatag ng modernong estado, ang mga ninja na itinuring na "hindi na kailangan" ay binago ang kanilang pangalan at papel bilang mga "Ninjer," at lihim na kumikilos sa likod ng higanteng lungsod ng Augus. Isang araw, biglang lumitaw sa harap ni Kagari ang kanyang dating kasama na ninja na si Imori at humiling ng isang mapanganib na trabaho. Si Imori, na nagtatrabaho bilang security guard sa kumpanyang Tris Farm Co., Ltd., ay nagbabalak na nakawin ang ilegal na pondo ng Tris Farm para magamit bilang pondo sa pagtakas! Dahil iniligtas ni Imori ang kanyang buhay noon, hindi makatanggi si Kagari at nag-infiltrate sa Tris Farm, ngunit ito pala ay isang pakana ng "Yanninshu" upang kunin ang kanyang buhay! Nahulog sa bitag, si Kagari ay mapipilitang sumailalim sa mga nakakahiyang parusa...
