Terahashi, seorang otaku sains yang bersekolah di sekolah unggulan, menjalani hari-harinya dengan menerima perundungan yang mengerikan dari teman sekelasnya. Satu-satunya penyelamat baginya adalah keberadaan Toujo Natsu, seorang siswi teladan yang selalu melindunginya. Bagi Terahashi, Natsu adalah "tempat suci (malaikat)" yang memahaminya dan tidak boleh dikotori, dan satu-satunya tujuan hidupnya adalah mengambil foto candid gadis itu secara diam-diam dan memandangi foto-fotonya. Namun suatu hari, Terahashi secara tidak sengaja menyaksikan pemandangan yang seharusnya tidak ia lihat. Itu adalah sosok Natsu yang bertemu secara rahasia dengan Yamada, seorang guru yang sudah menikah, di dalam sekolah dan tenggelam dalam gairah asmara. Merasa dikhianati, perasaan cinta Terahashi terhadap Natsu berubah menjadi obsesi yang gelap. Keesokan harinya, Terahashi memanggil Natsu ke ruang kelas setelah jam sekolah berakhir...
